在WTO農業(yè)多邊協議框架下，農業(yè)補貼具有兩層含義：一種是廣義補貼，即政府對農業(yè)部門的所有投資或支持，其中較大部分如對科技、水利、環(huán)保等方面投資，由于不會對產出結構和農產品市場發(fā)生直接顯著的扭曲性作用，一般被稱為“綠箱”政策。 “綠箱”政策措施主要包括：①一般農業(yè)服務，如農業(yè)科研、病蟲害控制、培訓、推廣和咨詢服務、檢驗服務、農產品市場促銷服務、農業(yè)基礎設施建設等；②糧食安全儲備補貼；③糧食援助補貼；④與生產不掛鉤的收入補貼；⑤收入保險計劃；⑥自然災害救濟補貼；⑦農業(yè)生產者退休或轉業(yè)補貼；⑧農業(yè)資源儲備補貼；⑨農業(yè)結構調整投資補貼；⑩農業(yè)環(huán)境保護補貼；地區(qū)援助補貼。
如對糧食等農產品提供的價格、出口或其他形式補貼，這類補貼又稱為保護性補貼，通常會對產出結構和農產品市場造成直接明顯的扭曲性影響，一般被稱為“黃箱”政策。主要包括政府對農產品的直接價格干預和補貼，種子、肥料、灌溉等農業(yè)投入品補貼、農產品營銷貸款補貼、休耕補貼等。WTO《農業(yè)協定》的“黃箱”政策中規(guī)定給予發(fā)展中國家特殊差別待遇，對發(fā)展中國家為促進農業(yè)和農村發(fā)展所采取的下述支持和補貼措施可免予削減承諾，簡稱“發(fā)展箱”。主要包括：①農業(yè)投資補貼；②對低收入或資源貧乏地區(qū)生產者提供的農業(yè)投入品補貼；③為鼓勵生產者不生產違禁麻醉作物而提供的支持.
中國入世前農業(yè)補貼政策的演化是由政府主導的強制性制度變遷，政府壟斷性供給農業(yè)補貼制度，農民的財產所有權和獨立人格沒有完全確立，政府與農民在補貼及其他福利上的博弈是一次性的，農民處于劣勢，也就注定其政策效率的低下。隨著經濟全球化和中國入世，以及農民社會地位和財產權的穩(wěn)定，政府與農民將在農業(yè)補貼上構成一種多次重復博弈機制，形成一個新的農業(yè)補貼政策框架，雙方在這個規(guī)則下獲取各自的行動信息，并決定其合作態(tài)度，當特定環(huán)境發(fā)生改變時，雙方可以成功地采取策略加以應對，及時獲得競爭優(yōu)勢。因此，有效的農業(yè)補貼政策將是政府與農民（或相關企業(yè)）共同選擇的結果。
