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水稻“自私基因”挑戰(zhàn)經(jīng)典定律

  北京時(shí)間6月8日,國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)》在線發(fā)布了“水稻自私基因?qū)е路敲系聽栠z傳”研究成果。自私基因系統(tǒng)控制水稻雜種不育,并影響稻種基因組的分化。此次研究成果,將為水稻雜交育種以及有效提高水稻產(chǎn)量,提供有力理論和技術(shù)支撐

  據(jù)介紹,“水稻自私基因?qū)е路敲系聽栠z傳”這一研究成果由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院與南京農(nóng)業(yè)大學(xué)共同合作完成,研究受到中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程的大力支持。對(duì)此,經(jīng)濟(jì)日?qǐng)?bào)記者采訪了研究團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人,中國(guó)工程院院士、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院副院長(zhǎng)萬(wàn)建民。

  增產(chǎn)的秘密

  水稻秈粳雜交可比其他雜交稻進(jìn)一步提高單產(chǎn)15%至30%。然而,秈稻和粳稻在雜交中會(huì)出現(xiàn)花粉不育、小穗結(jié)實(shí)率低等雜種不育現(xiàn)象,亟待科學(xué)攻關(guān)

  我國(guó)是水稻的發(fā)源地,在長(zhǎng)達(dá)7000多年的馴化過(guò)程中,水稻家族演化出秈稻和粳稻兩大亞種。

  其中,秈稻比較適宜生長(zhǎng)在高溫、強(qiáng)光和多濕的熱帶及亞熱帶地區(qū),主要分布在我國(guó)的華南熱帶和淮河以南的亞熱帶低地;粳稻比較適宜生長(zhǎng)在氣候暖和的溫帶、熱帶高地,在我國(guó)主要分布于南部熱帶、亞熱帶的高地,華東太湖流域以及華北、西北、東北等溫度較低的地區(qū)。

  近幾十年來(lái),雜交水稻技術(shù)的推廣為我國(guó)糧食增產(chǎn)作出了巨大貢獻(xiàn)。但是,目前的雜交水稻都集中在單一亞種之間,比如袁隆平院士的雜交水稻、綠色超級(jí)稻等,都是在秈稻亞種之間進(jìn)行的雜交。

  科學(xué)界普遍認(rèn)為,水稻秈粳雜交可比其他雜交稻進(jìn)一步提高單產(chǎn)15%至30%。“這對(duì)于提高水稻產(chǎn)量,保障國(guó)家糧食安全有著至關(guān)重要的作用。”萬(wàn)建民說(shuō)。

  然而,秈稻和粳稻在雜交中存在的最大問(wèn)題是:水稻會(huì)出現(xiàn)花粉不育、小穗結(jié)實(shí)率低、籽粒不飽滿等雜種不育現(xiàn)象,通常有50%左右不能結(jié)實(shí)。

  “常規(guī)水稻品種結(jié)實(shí)率要在80%以上,但是,秈粳雜交只有不高于50%的結(jié)實(shí)率。”萬(wàn)建民坦言,結(jié)實(shí)率80%以上是一個(gè)前提,如果達(dá)不到這個(gè)標(biāo)準(zhǔn),就無(wú)法實(shí)現(xiàn)增產(chǎn)目標(biāo)。

  而在此次發(fā)布的研究成果中,萬(wàn)建民團(tuán)隊(duì)采用了栽培稻粳稻品種和南方野生稻品種為研究材料。之所以選擇這兩個(gè)品種,是因?yàn)槟戏揭吧臼乾F(xiàn)代栽培秈稻粳稻的共同祖先,它攜帶了更多、更全面的遺傳基因。

  在試驗(yàn)中,研究人員發(fā)現(xiàn),栽培稻粳稻與南方野生稻雜交后,雜種雖然能長(zhǎng)出更多穗粒,但絕大部分都是空稻殼,最終結(jié)實(shí)率僅有1%至2%,基本可以忽略不計(jì)。由此,科學(xué)家們提出了假設(shè)——一定是有哪些基因控制了雜交稻不結(jié)實(shí)。

  “所以,我們要找出其不結(jié)實(shí)的原因,同時(shí)找到如何讓其結(jié)實(shí)的辦法。”萬(wàn)建民告訴記者。

  “自私”的基因

  自私基因是父本或母本中能控制其自身的DNA片段將優(yōu)先遺傳給后代的基因,從而維持物種自身的穩(wěn)定性。而粳稻中的毒基因產(chǎn)物“自私”地將南方野生稻的配子殺死了

  那么,栽培稻粳稻與南方野生稻雜交后,為什么不結(jié)實(shí)呢?

  隨著研究的深入,萬(wàn)建民及團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)了其中的奧秘,因?yàn)榫揪哂幸豁?xiàng)神秘“武器”——自私基因。

  什么是自私基因?它是干什么用的?

  英國(guó)演化理論學(xué)者理查德·道金斯在其經(jīng)典著作《自私的基因》中給出了詳細(xì)闡述,這一概念說(shuō)的是雙親雜交后,父本或母本中能控制其自身的DNA片段將優(yōu)先遺傳給后代的基因,使親本自身的遺傳信息能更多、更快地復(fù)制,并能更多地傳遞給子代,從而維持物種自身的穩(wěn)定性。

  “拿人類作比方,父母能控制住自身基因的將更多地傳遞給后代,所以大部分人都是像父母一方的多,而像另一方的少,這種類型的基因稱為自私基因。”萬(wàn)建民對(duì)記者說(shuō),但值得注意的是,這一現(xiàn)象卻不符合孟德爾遺傳定律。經(jīng)典定律認(rèn)為,基因是有均等機(jī)會(huì)分配給后代的,即父母雙方的基因遺傳給后代的概率是等同的。而實(shí)際情況是,大部分人都更像父母中的某一方。所以,人類在遺傳過(guò)程中,也出現(xiàn)了大量的“自私現(xiàn)象”。

  對(duì)于這種現(xiàn)象的研究,在上世紀(jì)90年代就有相關(guān)研究文章出現(xiàn)。2017年,《科學(xué)》雜志報(bào)道了小鼠和線蟲自私基因的非孟德爾遺傳現(xiàn)象。這些研究表明,在動(dòng)物中,自私基因驅(qū)動(dòng)了基因組的進(jìn)化,并影響了物種自身的穩(wěn)定性。此次水稻自私基因的發(fā)現(xiàn),在植物界尚屬首例。

  萬(wàn)建民及團(tuán)隊(duì)在研究中發(fā)現(xiàn),粳稻擁有的自私基因位點(diǎn)包含3個(gè)相鄰的基因ORF1、ORF2和ORF3,第一個(gè)基因沒有什么作用,第二個(gè)基因是毒蛋白,起到殺死配子的作用,第三個(gè)基因是解毒蛋白,起到保護(hù)配子的作用。而南方野生稻只含有ORF1、ORF2兩個(gè)基因,并不具有保護(hù)配子的基因。

  因此在雜交后,粳稻中的毒基因產(chǎn)物將南方野生稻的配子殺死了,也就是說(shuō),粳稻的自私基因發(fā)揮了作用,同時(shí)用ORF3基因保護(hù)了自己的配子,這就是自私現(xiàn)象。

  論文第一作者余曉文博士打了個(gè)比方,解毒蛋白類似花粉發(fā)育過(guò)程中的“護(hù)花使者”,若早期的花粉細(xì)胞中不含有解毒蛋白,其發(fā)育過(guò)程中會(huì)因?yàn)闆]有受到保護(hù),不可避免地受到毒蛋白的“毒害”,最終導(dǎo)致死亡;而含有解毒蛋白的花粉細(xì)胞,它的發(fā)育過(guò)程猶如多了一層保護(hù),會(huì)自動(dòng)消除毒蛋白的毒害作用,順利完成發(fā)育,使親本自身的遺傳信息更多地傳遞給后代,“自私”地維持了物種自身的穩(wěn)定性。

  “此次研究成果對(duì)我們解決秈粳雜交不育將起到重大作用,我們可以針對(duì)自私基因進(jìn)行基因編輯,刪除毒蛋白基因,同時(shí)選擇保留解毒基因,從而徹底解決秈粳雜交不育問(wèn)題。”萬(wàn)建民如是說(shuō)。

  基因的“矛”與“盾”

  水稻中緊密連鎖的基因ORF2和ORF3的產(chǎn)物,是類似于“矛”與“盾”關(guān)系的毒蛋白和解毒蛋白。在漫長(zhǎng)的演化過(guò)程中,解毒蛋白可以“選擇性”地保護(hù)攜帶它的花粉,確保其可育

  論文第一作者、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院趙志剛教授介紹說(shuō),這種類似于“矛”與“盾”關(guān)系的毒蛋白和解毒蛋白,其實(shí)就是水稻中緊密連鎖的基因ORF2和ORF3的產(chǎn)物。他們以亞洲栽培稻品種滇粳優(yōu)1號(hào)和南方野生稻為研究材料,發(fā)現(xiàn)ORF2基因編碼了一個(gè)毒性蛋白,對(duì)全部花粉的發(fā)育具有毒害作用;而ORF3基因則編碼了一個(gè)解毒蛋白,“選擇性(配子體效應(yīng))”地保護(hù)攜帶它的花粉,確保其可育,非常“自私”。研究發(fā)現(xiàn),普通野生稻中,約50%的材料含有ORF3,在經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期的演化之后,90%以上都含有ORF3。

  有意思的是,萬(wàn)建民院士科研團(tuán)隊(duì)還探尋出了水稻自私基因演化的“古戰(zhàn)場(chǎng)”。“大反派”毒蛋白ORF2原本只是個(gè)“跑龍?zhí)住钡模軌驅(qū)⑵洹袄K之以法”的解毒蛋白ORF3其實(shí)是由一個(gè)看似微不足道的ORF1基因進(jìn)化而來(lái)的。在漫長(zhǎng)的“祖先野生稻—普通野生稻—亞洲栽培稻”的演化過(guò)程中,ORF1沒有功能,但一直被保留;ORF2是從沒有毒性功能的單倍型逐步演變成有毒性功能的單倍型;而ORF3則是在普通野生稻中由ORF1基因的復(fù)制而產(chǎn)生,并在隨后的稻種馴化過(guò)程中,傳遞到亞洲栽培稻中。

  值得一提的是,20多年來(lái),萬(wàn)建民院士團(tuán)隊(duì)一直致力于破解“秈粳交”雜種優(yōu)勢(shì)有效利用難題。2015年,他們發(fā)掘出水稻廣親和、早熟和顯性矮稈基因,開發(fā)出相應(yīng)分子標(biāo)記和育種技術(shù),成功培育秈粳交高產(chǎn)水稻新品種,榮獲國(guó)家技術(shù)發(fā)明獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)。

  該團(tuán)隊(duì)這次在《科學(xué)》期刊發(fā)表的突破性成果,延續(xù)了雜種優(yōu)勢(shì)利用的科學(xué)命題,首次用自私基因模型揭示了水稻的雜種不育現(xiàn)象,闡明了自私基因在維持植物基因組的穩(wěn)定性、促進(jìn)新物種的形成中的分子機(jī)制,探討了毒性—解毒分子機(jī)制在水稻雜種不育上的普遍性,為揭示水稻秈粳亞種間雜種雌配子選擇性致死的本質(zhì)提供了理論借鑒。在實(shí)踐意義上,可以創(chuàng)制“廣親和”材料,克服雜種不育障礙,充分利用雜種優(yōu)勢(shì)和野生種質(zhì)資源,提高水稻單產(chǎn)。


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