漁業是國家戰略產業，在保障優質食物蛋白供給，改善居民膳食營養結構，維護水域生態安全方面發揮重要作用。近年來，漁業資源環境趨緊，發展空間受限，實現漁業綠色發展和可持續發展的難度加大。《關于創新體制機制推進農業綠色發展的意見》提出推行水產健康養殖制度，健全水生生態保護修復制度。實現這一目標，就是要堅持提質增效、減量增收、綠色發展、富裕漁民，以健康養殖、適度捕撈、保護資源、做強產業為方向，大力推進漁業供給側結構性改革，加快轉變漁業發展方式，提升漁業生產標準化、綠色化、產業化、組織化和可持續發展水平。

　　推行水產健康養殖制度。完善養殖水域灘涂規劃，科學劃定禁止養殖區、限制養殖區和養殖區，嚴格控制限養區養殖規模，科學確定養殖容量和品種。優化水產養殖布局，穩定近海養殖規模，拓展外海養殖空間，合理確定湖泊、水庫等公共水域內養殖規模，穩定池塘養殖。大力發展水產標準化生態健康養殖，積極發展大水面生態增養殖、工廠化循環水養殖、池塘工程化循環水養殖、種養結合稻田養殖、海洋牧場立體養殖、外海深水網箱養殖等健康養殖模式，深入開展水產健康養殖示范場和示范縣創建活動。推動建立水產養殖清潔生產制度，加強全價人工配合飼料的研發和推廣，加快推進水產養殖節水減排。優化養殖品種結構，加強品種創新，積極推廣新品種，大力發展適銷對路的名特優品種、高附加值品種、低消耗低排放品種。強化水生動物疫病防控，加快建立漁業官方獸醫制度，推進水產苗種產地檢疫和監督執法，加強重大水生動物疫病監測預警，支持漁用疫苗研發推廣，提高疫病防控和應急處置能力。

　　推進水生生物保護。加快推進長江流域全面禁捕，率先在長江流域水生生物保護區實現禁捕。實施海洋漁業資源總量管理制度，完善海洋漁船“雙控”和伏季休漁制度，繼續推進減船轉產，開展捕撈限額試點，嚴厲打擊“絕戶網”等非法捕撈行為。開展漁業資源調查和生態環境監測，建立健全漁業資源生態補償機制，監督落實補救措施。制定增殖漁業發展規劃，加大增殖放流力度。積極推進以海洋牧場建設為主要形式的區域性綜合開發，建立以人工魚礁為載體，底播增殖為手段，增殖放流為補充的海洋牧場示范區。加強水生生態保護修復，推進以漁凈水，促進湖庫漁業轉型升級和生態環境修復協調發展。