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“云上黑山羊”基因身份證和50K育種芯片研發(fā)成功 提高黑山羊精準(zhǔn)育種水平和育種效率近日從云南省科技廳了解到,省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院羊產(chǎn)業(yè)技術(shù)研發(fā)與應(yīng)用創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)成功研發(fā)出“云上黑山羊基因身份證”和“云上黑山羊50K育種芯片”,可用于“云上黑山羊”的精準(zhǔn)鑒定,并提高其精準(zhǔn)育種水平和育種效率。研發(fā)成果將為規(guī)范“云上黑山羊”種羊推廣、提高種質(zhì)價值、開展持續(xù)選育提供技術(shù)支撐,助推云南省肉羊產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展。 為鑒定“云上黑山羊”純種,有效開展種業(yè)市場監(jiān)管,維護(hù)其品牌價值,省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院研究團(tuán)隊(duì)對我國南方主要的4個黑山羊品種(類群)160只個體進(jìn)行深度基因組重測序獲取各品種特異性位點(diǎn)后,對3072個樣本進(jìn)行分型檢測,借助機(jī)器學(xué)習(xí)方法建立了“云上黑山羊”鑒定模型并完成模型的優(yōu)化,挖掘出能夠作為純種“云上黑山羊”基因標(biāo)識鑒定的26個SNP位點(diǎn),最終研發(fā)出“云上黑山羊基因身份證”。目前該基因身份證鑒定成功率達(dá)90%,是國內(nèi)唯一開展“云上黑山羊”品種鑒定的試劑盒。 “云上黑山羊50K育種芯片”基于山羊通用芯片功能位點(diǎn),融合了74個“云上黑山羊”繁殖性狀、生長性狀和基因身份證的功能位點(diǎn)共計(jì)50000個SNP位點(diǎn),平均檢出率可達(dá)98.77%,分型一致性可達(dá)99.30%,相較于通用芯片檢測成本降低了三成。該芯片不但可用于“云上黑山羊”全基因組選擇育種、重要經(jīng)濟(jì)性狀功能基因挖掘,還可用于云南本地山羊種質(zhì)資源創(chuàng)新利用與保護(hù)、親緣關(guān)系鑒定等,是目前國內(nèi)唯一一款“云上黑山羊”育種芯片,相較通用芯片,在降低分子育種成本、提高選種準(zhǔn)確率方面優(yōu)勢明顯。 “云上黑山羊”是由省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院聯(lián)合省內(nèi)多家單位歷時22年培育的我國第一個肉用黑山羊新品種。2023年6月,該品種被農(nóng)業(yè)農(nóng)村部列為全國主導(dǎo)品種。近10年來,科研團(tuán)隊(duì)聯(lián)合企業(yè)加大成果轉(zhuǎn)化應(yīng)用力度,在全國20余個省(區(qū)、市)和云南省120個縣(市、區(qū))累計(jì)推廣“云上黑山羊”種羊15萬余只,獲綜合經(jīng)濟(jì)效益300多億元。云南省內(nèi)覆蓋面達(dá)93%,占全省山羊種羊市場的94%,累計(jì)帶動1.5萬戶群眾增收致富。 |