日前，中國水產(chǎn)科學(xué)研究院珠江水產(chǎn)研究所聯(lián)合深圳華大基因研究院、新加坡國立大學(xué)淡馬錫生命科學(xué)研究院等單位組建國際合作研究團隊聯(lián)合破譯了美麗硬仆骨舌魚全基因組圖譜。4月19日，研究團隊在Nature子刊《Scientific Reports》在線發(fā)表相關(guān)研究結(jié)果(《The Asian arowana (Scleropagesformosus) genome provides new insights into the evolution of an early lineage of teleosts》)。

　　美麗硬仆骨舌魚，俗稱亞洲龍魚，有“活化石”之稱，是世界上最古老而又名貴的魚類之一，同時是國際一級保護魚類，具有較高的經(jīng)濟價值、文化價值和科研價值。自然界中，它主要有金龍魚、紅龍魚和青龍魚三個亞種。

　　珠江所經(jīng)十多年的科研攻關(guān)，建立我國大陸美麗硬仆骨舌魚核心基礎(chǔ)繁育群體，并在2007年和2013年分別成功繁育出我國大陸F1代和F2代幼魚，引起國內(nèi)外業(yè)界的關(guān)注。為深入研究這一古老魚類的遺傳特征，研究人員中運用深度鳥槍法測序結(jié)合高分辨率連鎖作圖策略，對1尾雌性金龍魚進行全基因組測序，并對97個過背金龍魚X紅龍魚家系個體進行RAD測序，獲得高質(zhì)量的染色體水平參考基因組(25對染色體)，也完成了紅龍魚和青龍魚兩個亞種的基因組草圖。金龍魚、紅龍魚和青龍魚三個亞種裝配后的基因組大小分別779Mb、753Mb和759Mb。系統(tǒng)進化分析提出了一個新的觀點：骨舌總目和海鰱總目互為姐妹群，兩個演化支的組合與包含其他所有硬骨魚的骨鰾總目形成姐妹群。在基因?qū)用妫琀ox基因家族是生物體中作為專門調(diào)控生物形體的一類基因，金龍魚基因組是目前測序基因組中唯一保留了全部8個Hox基因簇，與同屬骨舌魚目的非洲蝴蝶魚僅剩有5個Hox基因簇不同。研究中還發(fā)現(xiàn)一個潛在的雌性異配性染色體，與已知ZW性別決定機制的半滑舌鰨基因組比對發(fā)現(xiàn)，美麗硬仆骨舌魚17號染色體與Z、W染色體匹配度最高(分別為89%和40%)，推斷美麗硬仆骨舌魚為ZW/ZZ性別決定機制。

　　此次對其全基因組序列的解析，不僅對從基因組水平挖掘美麗硬仆骨舌魚生長、體色、免疫、繁育和生態(tài)適應(yīng)等重要性狀的分子機制具有重要科學(xué)意義和應(yīng)用價值，而且也為魚類基因組演化、性別決定及分化機制等理論研究及物種保護和品種的遺傳改良奠定重要基礎(chǔ)。同時，也為今后破解美麗硬仆骨舌魚性別決定機制、全基因組分子育種及其技術(shù)提供了重要的基因資源。